Согласно президентского указа Шухрат Ганиев назначен на должность хокима Ферганской области.
Даннный указ был подписан 14 декабря 2012 года.
Ранее, с ноября 2011 года Ганиев занимал должность исполняющего обязанности хокима Ферганской области.
На этот пост он был назначен после работы в качестве первого заместителя хокима Ферганской области по вопросам сельского и водного хозяйства.